در داردانل و شهرهای یونانی نشین قبرس که نیروی دریایی قدرتمندی داشت شورش های ضد هخامنشی برپا شد. در این زمان شماری از دریانوردان فنیقی راهی قبرس شدند و آن جزیره را تصرف کردند و زیر بیرق ایران درآوردند. نیروی دریایی قبرس خیلی زود به ایران پیوست و شورشیان یونانی کشتی های خود را در قبرس از دست دادند. با ادامه شورش ها در مستعمرات ایونی در ساحل غربی تراکیه در سال 496ق.م داریوش دستور داد کارگاه های کشتی سازی فنیقی، ساخت کشتی های جنگی را تسریع کنند. ایونی ها حریف نیروی دریایی ایران نشدند.